Docking을 이용한Leishmania mexicana inhibitor 분석 및 개발 전략 연구

Docking을 이용한Leishmania mexicana inhibitor 분석 및 개발 전략 연구

썸네일 Challenge 애게서 업로드 하였습니다. 19. 7. 4 오후 3:22
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Leishmaniasis는 Leishmania spaice에 의해 발병하는 심각한 질병이다. 현재 이를 치료하는 약물이 다양하게 개발되고 있지만 그 완치율은 높지 않고 부작용도 심해 더 많은 연구가 필요한 실정이다. 본 연구에서는 EDISON에서 제공하는 QM_Docking_Dock 프로그램을 이용해 binding affinity를 계산하고 관찰하였다. L.mexicana의 GAPDH를 저해하는 전략에 사용된 화합물 BRZ960, TND361 각각의 계산 결과는 5.74461 kcal/mol, -6.03565 kcal/mol이며 이는 실험 결과인 IC50과 비슷한 경향을 가진다. 그리고 TND361는 Homo sapiens의 GAPDH구조를 구별하지 못해 부작용에 노출되어 있음을 알 수 있었으며, 비교적 활성이 좋은 TND361은 L. mexicana GAPDH 39 MET의 sulfate와 TND361의 phenol ring과 Pi-surfer interaction을 형성하며 Homo sapiens의 39 PHE에 의해 결합을 못해 기생충에만 특이적으로 작용하는 약물임을 알 수 있었다. 마지막으로 약물 메커니즘이 NAD의 경쟁적 저해제이기 때문에 NAD보다 더 강력하게 붙는 특징과 Homo sapiens에 작용하지 않는 특징, 이 두 가지 특성을 지닌 약물을 개발 또는 발굴하는 것이 약물의 문제점을 해결하는 연구가 될 것이다.
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태그: metal_alloy sejong_lj uchem qm_dock_docking qm_dock_esp wabars
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19. 7. 4 오후 4:03
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Leishmaniasis는 Leishmania spaice에 의해 발병하는 심각한 질병이다. 현재 이를 치료하는 약물이 다양하게 개발되고 있지만 그 완치율은 높지 않고 부작용도 심해 더 많은 연구가 필요한 실정이다. 본 연구에서는 EDISON에서 제공하는 QM_Docking_Dock 프로그램을 이용해 binding affinity를 계산하고 관찰하였다. L.mexicana의 GAPDH를 저해하는 전략에 사용된 화합물 BRZ960, TND361 각각의 계산 결과는 5.74461 kcal/mol, -6.03565 kcal/mol이며 이는 실험 결과인 IC50과 비슷한 경향을 가진다. 그리고 TND361는 Homo sapiens의 GAPDH구조를 구별하지 못해 부작용에 노출되어 있음을 알 수 있었으며, 비교적 활성이 좋은 TND361은 L. mexicana GAPDH 39 MET의 sulfate와 TND361의 phenol ring과 Pi-surfer interaction을 형성하며 Homo sapiens의 39 PHE에 의해 결합을 못해 기생충에만 특이적으로 작용하는 약물임을 알 수 있었다. 마지막으로 약물 메커니즘이 NAD의 경쟁적 저해제이기 때문에 NAD보다 더 강력하게 붙는 특징과 Homo sapiens에 작용하지 않는 특징, 이 두 가지 특성을 지닌 약물을 개발 또는 발굴하는 것이 약물의 문제점을 해결하는 연구가 될 것이다.
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