단백질 복합체 비교를 통한 단백질-단백질 상호작용의 열역학적 분석

단백질 복합체 비교를 통한 단백질-단백질 상호작용의 열역학적 분석

썸네일 Challenge 애게서 업로드 하였습니다. 19. 7. 4 오후 3:22
평균 (0 투표)
p53-MDM2 복합체와 barnase-barstar 복합체는 생체 내에서 결합을 이루고 있다. 열역학적 분석 방법 중 하나인 유효 결합 자유 에너지(effective binding free energy)인 단백질 내부에너지(protein internal energy)와 용매화 자유에너지 (solvation free energy)의 합으로 구성된다. 본 연구에서는 유효 결합 자유 에너지와 잔기 별 용매화 자유에너지 계산을 통하여 결합 계면의 차이를 분석하였다. 연구의 결과로 용매화 자유에너지 분석을 통해 단백질 간의 결합의 주 원인은 p53-MDM2 복합체에서는 소수성 때문이고, barnase-barstar 복합체에서는 친수성의 정전기적 상호작용 때문임을 확인했다. MD시뮬레이션과 용매화 자유에너지 분석을 이용하여 단백질이 복합체를 이루는 원인을 분석함으로써, 단백질이 결합하는 데 있어 상호작용하는 추진 요인이 다르다는 것을 열역학적으로 규명하였다.
경진대회: 계산화학 계산화학 » 8회 경진대회
태그: sfe_calc_v2
1 Of 7
코멘트
아직 코멘트가 없습니다. Please sign in to comment.

버전 1.1

Challenge가 마지막으로 수정함
19. 7. 4 오후 3:56
상태: 승인됨
p53-MDM2 복합체와 barnase-barstar 복합체는 생체 내에서 결합을 이루고 있다. 열역학적 분석 방법 중 하나인 유효 결합 자유 에너지(effective binding free energy)인 단백질 내부에너지(protein internal energy)와 용매화 자유에너지 (solvation free energy)의 합으로 구성된다. 본 연구에서는 유효 결합 자유 에너지와 잔기 별 용매화 자유에너지 계산을 통하여 결합 계면의 차이를 분석하였다. 연구의 결과로 용매화 자유에너지 분석을 통해 단백질 간의 결합의 주 원인은 p53-MDM2 복합체에서는 소수성 때문이고, barnase-barstar 복합체에서는 친수성의 정전기적 상호작용 때문임을 확인했다. MD시뮬레이션과 용매화 자유에너지 분석을 이용하여 단백질이 복합체를 이루는 원인을 분석함으로써, 단백질이 결합하는 데 있어 상호작용하는 추진 요인이 다르다는 것을 열역학적으로 규명하였다.
다운로드 (752k) URL 또는 Webdav URL 가져오기
버전 히스토리
버전 날짜 크기  
1.1 3 년 전 752k
1.0 3 년 전 752k